BMS 的 LPAR1 抑制剂在 3 期肺纤维化 RCT 中达到主要终点，验证 Andy Tager 的 LPAR1 发现
BMS 宣布其 LPAR1 抑制剂在 3 期肺纤维化随机对照试验中达到主要终点。该靶点在肺纤维化中的作用由 9 年前去世的 Andy Tager 发现，此次结果被视为对其科学遗产的确认。
全部生信动态
Bluesky：KaminskiMed (@kaminskimed.bsky.social)AI 评分2020 David R. LiuAI 评分4848 BeamTx 公布 GSD I 型碱基编辑临床数据
David R. Liu 概述碱基编辑与先导编辑的临床试验格局，并提及 Beam Therapeutics 当日公布的 GSD I 型临床试验结果。
RecursionAI 评分2222 Recursion 一日完成计算药物设计全流程
Recursion 称其 AI 原生引擎可在约一天内跑完整个计算设计周期，把数百万个候选分子筛成一份可合成的高质量短名单。流程先用 Nesso-1 等 3D 结构模型给结合亲和力打分，再调用数百个覆盖 ADME、效力、模拟与 AI 逆合成的模型联合过滤。公司称这套系统让化学家能探索全新化学空间，并在分子尚不存在时预测合成路线。
Bioinformatics Advances精选AI 评分6767 TorchGWAS 1.0 发布：GPU 加速大规模 GWAS
TorchGWAS 1.0 发布，这是一个用 GPU 批量运算对大量定量表型做协变量校正线性关联检验的框架。
推荐理由：面对数千个定量表型逐个做 GWAS 的算力瓶颈，该工具给出与 PLINK 2.0 一致的统计量和大规模运行时间。
ScienceDaily精选AI 评分8888 DNA Typewriter 记录小鼠胚胎细胞谱系，重建从受精卵到器官形成的家族树
研究团队用 DNA Typewriter 在小鼠胚胎中记录细胞分裂历史，重建了从受精卵第一次分裂到胚胎发育第 13.5 天的细胞家族树，成果于 2026 年 10 月 8 日发表在 Science。
推荐理由：用 DNA Typewriter 在小鼠胚胎中重建细胞谱系，可对照不同组织命运决定时间的差异。
EMBL NewsAI 评分3636 地球大脑健康委员会首份报告：如何将心理健康纳入环境与气候决策
地球大脑健康委员会在《Nature Mental Health》发布首份报告，提出未来十年内任何重大环境干预的设计与评估都须纳入心理健康影响评估。报告指出极端天气、空气与噪声污染、城市压力源、生物多样性丧失及社会不平等与焦虑、抑郁、创伤相关障碍和认知衰退风险升高相关，并建议自2027年起将心理健康指标纳入气候计划、环境影响评估和城市政策。
Bluesky：Vienna Airway Lab (@viennaairwaylab.bsky.social)AI 评分3838 Dupilumab 治疗无鼻息肉慢性鼻窦炎的随机双盲安慰剂对照 II 期研究
一项随机双盲安慰剂对照 II 期研究评估了 Dupilumab 对无鼻息肉慢性鼻窦炎（CRSsNP）患者的疗效，报告称这是首个在该人群中验证生物制剂疗效的随机临床试验。Dupilumab 可减轻影像学病变。
Bluesky：Vienna Airway Lab (@viennaairwaylab.bsky.social)AI 评分3333 132 例 CRSwNP 患者的转录组与鼻腔微生物组联合分析揭示 4 种免疫-微生物内型及激素反应差异
对 132 例慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）患者整合转录组与鼻腔微生物组分析，识别出 4 种具有不同免疫-微生物特征和类固醇反应的内型。以 Staphylococcus 为主的 Cluster C 对附加全身糖皮质激素治疗的反应最高。
科学网AI 评分3636 中国科学院南京地质古生物研究所揭示有翅昆虫起源演化时序，破解"古翅类难题"
中国科学院南京地质古生物研究所等整合百余种昆虫基因组与转录组数据，首次测定16种我国蜉蝣全基因组，证实古翅类为单系类群、蜉蝣目与蜻蜓目互为姊妹群。基于13个化石校准点的分子钟分析显示，冠群有翅昆虫可追溯至早泥盆世，古翅类冠群起源于晚泥盆世，昆虫翅只演化了一次。研究还发现不完全谱系分选与基因树估计误差共同导致以往组学数据难以阐明古翅类系统发育关系。
公众号：英矽智能AI 评分5858 英矽智能提名口服外周限制性 VAV1 分子胶降解剂 ISM9546 为 PCC
英矽智能提名 ISM9546 为临床前候选化合物（PCC），这是一种口服、外周限制性的 VAV1 分子胶降解剂，拟用于炎症性肠病和类风湿性关节炎等自身免疫性疾病。
Nature Machine Intelligence精选AI 评分8282 AMIFound 统一 7 种医学影像的修复与增强
Cao 等人提出一体化基础模型 AMIFound，用于 CT、MRI、PET、内镜、超声、眼底成像和 X 射线 7 种医学影像的增强与修复。模型在 376 万对高质量与退化图像上训练和评估，覆盖 7 类代表性退化模式；共享编码器提取模态与退化线索，动态路由的专家修复池为每个输入选择增强路径。在 7 种模态上，AMIFound 在全参考图像质量指标、临床医生评估、组合退化鲁棒性测试以及自然退化临床图像上均优于 38 个任务专用与通用基线。增强后的图像还改善了 44 项疾病检测任务、肿瘤分期预测和非小细胞肺癌生存风险分层，包括个体层面的预后排序。
推荐理由：该模型用 376 万对图像统一处理 7 种医学影像的退化修复，并检验增强后对下游诊断任务的影响。
Nature Methods精选AI 评分6767 rsmiRFPnano：不到 19 kDa 的近红外光开关小蛋白用于光声分子成像
研究团队改造出 rsmiRFPnano，一种源自蓝细菌光敏色素、分子量低于 19 kDa 的近红外光开关光声成像探针，用于差分光声断层成像（PAT）。现有基于细菌光敏色素的探针多为超过 55 kDa 的多结构域蛋白，限制了 PAT 分子报告探针的设计；rsmiRFPnano 能高效结合胆绿素，在两种光开关状态下均有高消光系数，并在活细胞中表现稳定。作者据此构建了 NF-κB 和 AP-1 通路的报告探针，基础活性低、激活响应强，并在体内用无创 PAT 可视化急性炎症，还用细胞级空间组学图谱做了验证。
推荐理由：一种不到 19 kDa 的光开关蛋白把光声成像探针做小，并给出炎症与胞内抗原成像的验证路径。
Nature Biotechnology精选AI 评分7878 配体导向脂质纳米颗粒在体内生成 CAR NK 细胞
研究团队开发了靶向 NK 细胞的脂质纳米颗粒 NtLNPs，用工程化双靶向 NK 细胞配体驱动受体特异性摄取和 mRNA 递送，在小鼠中实现最高约 80% 的 NK 细胞转染且脱靶效应很小。经系统给药递送 CAR mRNA 可在体内生成 CAR NK 细胞：靶向 CD19 的 CAR NK 细胞在健康小鼠中完全清除循环 B 细胞，靶向 CD3 的 CAR NK 细胞在自身免疫性肝炎模型中清除几乎全部自身反应性 T 细胞，作者据此提出其在 T 细胞驱动疾病上可能优于 CAR T 疗法。
推荐理由：研究用双靶向配体修饰的 LNP 在小鼠体内直接生成 CAR NK 细胞，为体内细胞工程提供了可迁移的递送思路。
BioinformaticsAI 评分5858 Seumetry 发布开源 R 工具包，衔接 Seurat 分析高维流式与质谱流式数据
Seumetry 是一个开源 R 工具包，把流式与质谱流式数据的专用分析方法与 Seurat 的单细胞 RNA 测序分析能力结合起来。它提供高级质控、可视化和细胞群体丰度与蛋白表达的差异分析，作者用自建的人肠道不同层免疫细胞数据集验证其能识别不同免疫细胞群体，并在公开数据集上与人工门控结果一致。
Nature BiotechnologyAI 评分5858 六种蛋白组衰老时钟首次进入临床试验
六种蛋白组衰老时钟首次被部署到一项临床试验中，研究结果更多揭示了这些时钟本身的特性，而非药物效果。材料未给出试验规模、药物名称及具体结论。
PatternsAI 评分4040 跨物种树突计算用于仿生决策
Du 等人提出可训练的三室脉冲神经元模型 TNLP-LIF，将生物树突的线性与非线性输入处理机制转化为计算模型。研究结合跨物种工作记忆模拟与强化学习测试，显示树突整合可提升人工神经网络表现，但该模型仍是计算抽象而非对生物的直接复刻。
Nature Genetics精选AI 评分7575 人胰腺导管腺癌克隆异质性及其对肿瘤进展的影响
研究团队对 62 例原发胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤进行单细胞 RNA 测序（443,451 个细胞），并对其中 11 例肿瘤匹配空间转录组（53,236 个 spot），同时纳入 6 例化疗前后配对样本，刻画克隆、转录与空间多样性。分析发现同一肿瘤内共存多个遗传上不同的肿瘤克隆，克隆特异的配体-受体程序受基因组剂量调控：配体或受体扩增增强相应互作，缺失则抑制，空间转录组与多重免疫荧光支持这些遗传编码差异。
推荐理由：62 例原发肿瘤的单细胞与空间转录组图谱，把克隆异质性、8q24/MYC 扩增与经典-基底表型转换联系起来。
ScienceDailyAI 评分5858 维也纳大学团队发现头足类基因组三维重排与复杂神经系统演化的关联
维也纳大学研究人员重建了章鱼、鱿鱼和乌贼基因组的 3D 组织，发现数亿年前的大规模 DNA 重排把原本分离的染色体区域拉到一起，可能促成新的基因调控网络。研究发表于 Nature Communications，显示染色质结构域在演化中长期稳定，而染色质环在物种、组织和发育阶段间差异明显，且多位于神经系统相关基因附近。作者指出，结果并未证明这些 DNA 变化直接导致头足类智力的演化。
Bluesky：Paul Gardner (@ppgardne.bsky.social)AI 评分3838 Paul Gardner 批评 Springer Nature 对阿尔茨海默病造假研究仅作更正处理
Paul Gardner 批评 Springer Nature 对一篇阿尔茨海默病造假"研究"仅发布更正、未撤稿，也未解释该文与另外 11 篇论文的相似之处。他引用指出，12 篇伪造系统综述中有 4 篇收到 TB Emran 一夜之间发出的相同回复，MS Mubarak 一个月前也写过几乎相同的回复，至今无更新或撤稿。
Bluesky：raw9371 (@raw937.bsky.social)AI 评分4040 SENTINEL-X：整合 CheckV、CheckM2、BUSCO、EukCC 与 viralVerify 的 Rust 质控工具
SENTINEL-X 将 CheckV、CheckM2、BUSCO、EukCC 和 viralVerify 五个生信工具整合为单一 Rust 二进制，无需 Python 运行时，可对病毒、细菌和真核序列做质控。该工具已在 crates.io 发布。
Google Health Blog精选AI 评分5858 Google 总结用 AI 模型理解与治疗疾病的研究进展
Google 回顾其健康研究布局，称过去五年团队发表了 90 篇经同行评审的疾病相关论文，累计被引用超过 9 万次。
推荐理由：Google 汇总了 AlphaFold、AlphaGenome Atlas 等模型在疾病检测与药物发现上的落地案例，可快速了解其健康研究布局。
Asimov PressAI 评分3636 物种边界为何模糊：基因组学时代的微生物分类困境
基因组测序揭示水平基因转移（HGT）在微生物中远比此前假设的普遍，使生命之树的枝条交叉合并，模糊了物种边界。文章以临床微生物学家 Frank Koontz 对基因分类法的质疑为线索，梳理从 Linnaeus 到 Crick 提出“蛋白质分类学”的分类学史，并指出在美国工程微生物是否需接受监管审查取决于其外源 DNA 是否来自不同属。
Arc Institute精选AI 评分7878 eclair-CLIP构建67个RNA结合蛋白高分辨率结合图谱并训练Pythia模型
Arc Institute、Biohub、UCSF与Vector Institute团队开发eclair-CLIP，用统一小标签替代逐个抗体，在人类细胞中绘制67个癌症相关RNA结合蛋白（RBP）图谱，以单核苷酸分辨率定位超过900万个RNA结合位点。
推荐理由：用统一标签的CLIP方法构建67个癌症相关RBP的高分辨率结合图谱，并据此训练可解释的RNA结合预测模型。
Vivek Natarajan精选AI 评分8080 对话式诊断 AI 系统真实世界临床研究在 The Lancet 发表
Google 团队一项对话式诊断 AI 系统的真实世界临床研究在 The Lancet 发表，作者 Vivek Natarajan 回顾了从 2022 年接触 LaMDA 和 PaLM、到 2023 年 AMIE 模型自博弈训练、再到与 Beth Israel Deaconess 医疗中心合作开展前瞻性临床试验的历程。
推荐理由：作者以当事方视角复盘这项真实世界临床研究从模型自测到前瞻试验的推进过程，并给出安全性数据。
Bluesky：Matt Olm (@mattolm.bsky.social)AI 评分6767 Microbiome Repo 发布公开人类肠道宏基因组目录，收录超 50 万样本
Microbiome Repo 发布，收录了所有公开的人类肠道宏基因组，样本量超过 50 万，元数据直接从序列档案、论文和补充材料中提取。该目录同时提供公开 shotgun 宏基因组研究注册表，以及覆盖各年龄段、逐样本带元数据且标注证据来源的肠道宏基因组目录，作者邀请已发表相关研究的研究者检索自己的研究是否被收录并反馈。
Bioinformatics AdvancesAI 评分3131 基于转录组谱与共表达整合筛选金黄色葡萄球菌生物膜相关sRNA–mRNA互作
研究整合菌株Bmb9393新测转录组与5株金黄色葡萄球菌公共数据，在生物膜与浮游条件下注释并刻画小调控RNA的表达与基因组环境，鉴定出10个生物膜中一致上调、4个一致下调的小调控转录本。
科学网AI 评分5050 华中科技大学同济医学院附属协和医院研发国内首个高通道矩阵式电刺激脑机接口精细运动重建系统
华中科技大学同济医学院附属协和医院联合企业研发出国内首个“基于高通道矩阵式电刺激的脑机接口精细运动重建系统”，首位受试者为39岁脑胶质瘤致右侧肢体偏瘫患者，经近2个月训练已能完成右手指屈伸、按键并弹奏《小星星》。团队通过高密度硬膜外电极植入与精细动作运动想象训练建立精细运动与大脑活动的映射，并研发柔性矩阵式多通道功能电刺激电极实现脑控精细运动。
Fabian Theis精选AI 评分4242 美日韩英德等 17 国在京都 STS Forum 签署《Kyoto Vision for a Golden Age of Science》
美国与日本、韩国、英国、德国、新加坡等共 17 国在京都 STS Forum 上签署一页篇幅的《Kyoto Vision for a Golden Age of Science》，内容涵盖更多元资助方式、新机构模式、元科学与可重复性、AI for science（含自主闭环发现）以及早期人才投入。
推荐理由：梳理多国科研政策文件对 AI for science 与资助模式的表述，并给出德国研究部门的保留态度。
科学网AI 评分2222 知名学者万逢义回国出任浙江大学求是讲席教授
美国约翰霍普金斯大学教授万逢义已全职回国加盟浙江大学，任求是讲席教授及浙大医学院附属第二医院经血管植入器械全国重点实验室教授，于2026年回国。其长期研究肠道感染、炎症与免疫应答，聚焦宿主-病原菌-肠道微生态互作，主持美国国立卫生研究院等资助项目20余项，发表论文近60篇。
Bluesky：James Briscoe (@jamesbriscoe.bsky.social)AI 评分3838 Philip Ball 在 Quanta Magazine 撰文解读 Waddington 景观与细胞命运决定
Philip Ball 在 Quanta Magazine 发表科普文章，讨论 Waddington 景观这一细胞命运决定隐喻。文中提及作者与 David Rand 利用动力系统理论和单细胞数据，使该景观隐喻可定量化并具备预测能力。
Bluesky：John Ebos (@ebos.bsky.social)精选AI 评分5858 Cell 观点文章评估生物医学 AI 向自主科学智能体的转变
Cell 刊发观点文章《Toward autonomous science with agentic artificial intelligence》，讨论生物医学 AI 正从回答人类提出问题的工具，转向能自行提出问题的智能体。Guo 等人评估了这一转变，涉及扩展逻辑与自主劳动等内容。
推荐理由：Cell 观点文章梳理生物医学 AI 从回答人类提问的工具转向自主提问的智能体，并讨论其扩展逻辑与自主科研的边界。
公众号：北大生科精选AI 评分6767 昌增益研究组揭示NH₄⁺与HCO₃⁻协同耗竭ATP触发细菌休眠并驱动蛋白质相分离
北京大学昌增益团队在Scientific Reports发表研究，提出细菌休眠由氨基酸氧化副产物NH₄⁺与HCO₃⁻协同触发，而非营养耗尽本身。两种代谢物同时存在时才会显著降低ATP水平，解除ATP对FtsZ、FtsA、MinD、AdhE、RplA等蛋白的增溶保护，使其以折叠态相分离组装成复苏延迟体；补充ATP可完全溶解凝聚体并恢复生长。
推荐理由：该研究把细菌休眠的触发从营养饥饿转向NH₄⁺与HCO₃⁻协同耗竭ATP，为理解持留与抗生素耐受提供新框架。
In the Pipeline精选AI 评分4242 2026 年诺贝尔化学奖解读：手性放大如何从非手性汤中产生
Derek Lowe 撰文解读 2026 年诺贝尔化学奖，主题是手性（“handedness”）与不对称自催化带来的手性放大。
推荐理由：借 2026 年诺贝尔化学奖梳理手性放大从 Frank 设想到 Soai 实验的来路，并说明它尚未解释生物手性起源。
Nature Genetics精选AI 评分7272 微核中的 ecDNA 限制肿瘤细胞适合度并与患者较好生存相关
研究发现 ecDNA 是微核的重要来源，复制压力下 ecDNA 发生有丝分裂聚集、不对称分配和错分进入微核，携带 ecDNA^+ 微核的细胞增殖能力下降、更易死亡。单微核测序显示多个不同 ecDNA 种类会汇聚到同一微核中；在 MYCN 扩增的神经母细胞瘤患者中，诊断时 ecDNA^+ 微核频率较高与总生存期改善相关。作者据此提出有丝分裂期 ecDNA 滞留可能成为治疗切入点。
推荐理由：研究把 ecDNA 的微核错分与适合度下降联系起来，并给出神经母细胞瘤患者生存关联，为理解 ecDNA 的代价提供新角度。
Wellcome Sanger Institute News精选AI 评分8888 Wellcome Sanger Institute 加入国际合作，为预测疾病的 AI 模型构建基础数据
Biohub、美国能源部（DOE）、美国国立卫生研究院（NIH）等资助方宣布扩大一项国际合作，共同投入 18 亿美元的资金、数据、算力和新测量技术，用于生成并开放可用于预测生物学 AI 模型的数据。Wellcome Sanger Institute、Human Cell Atlas、Human Protein Atlas、Allen Institute、Broad Institute 和 Gladstone Institutes 等机构参与其中，作为 Virtual Biology Initiative 的一部分推进。
推荐理由：这项跨国计划把测量技术、开放数据和标准化接口放在一起，可用来观察虚拟细胞类基础模型的数据底座如何搭建。
Cell Reports MethodsAI 评分5858 膜靶向 TurboID 实现清醒动物神经元回路 1–2 小时急性邻近标记蛋白质组学
Anguiano 等人改造出膜靶向 TurboID，并优化标记策略，在清醒动物神经元胞体和轴突末梢实现 1–2 小时的蛋白质标记窗口，用于鉴定各亚细胞区室富集的蛋白。研究针对的是在行为相关时间尺度上捕捉脑内亚细胞定位蛋白质组的工具不足问题，成果发表于 Cell Reports Methods。
Cell Reports MedicineAI 评分5050 口服代谢重编程益生菌 EcN-HlpA-CGL 通过级联激活抗肿瘤免疫抑制结直肠癌
Wang 等开发出口服代谢工程菌平台 EcN-HlpA-CGL（EHC），用于结直肠癌免疫治疗。该菌通过触发结直肠癌细胞铁死亡增强免疫原性，同时以细菌佐剂效应重塑免疫抑制微环境，激活全身与肠道黏膜免疫，有效抑制原位肿瘤生长与转移。
Europe PMC精选AI 评分4545 AI 驱动的 RNA 药物设计综述：从分子优化到系统级评估
这篇综述从分子优化与系统级评估的衔接角度梳理 AI 驱动的 RNA 药物设计，比较 siRNA、反义寡核苷酸、适配体、mRNA 和翻译导向 circRNA 各自的设计约束，并评估序列模型、生成模型和结构感知模型的能力与局限。
推荐理由：综述把 RNA 药物设计从分子优化延伸到系统层面评估，梳理了不同 RNA 模态的设计约束与虚拟细胞的定位。
Genomics, Proteomics & BioinformaticsAI 评分6060 单细胞多组学揭示系统性红斑狼疮免疫抑制治疗后仍存在的多维免疫失调
研究用单细胞多组学在真实临床场景下追踪系统性红斑狼疮（SLE）患者接受免疫抑制剂标准治疗期间的免疫组库动态，发现该疗法未能纠正 B 细胞和浆细胞的突变负荷下降，也未能阻止 CD4+ Th1 与 CD8+ 记忆 T 细胞的克隆扩增。作者还将自有数据与已发表的 SLE 数据集整合，构建了约 160 万细胞的 SLE 免疫图谱，并指出这些持续存在的失调可能与该病治疗后高复发率相关。
Ground Truths精选AI 评分7878 解读 Immunity 论文：GZMK+ 与 GZMB+ Tem 细胞比例关联免疫衰老与健康结局
Eric Topol 解读了 2026 年 10 月 9 日发表在 Immunity 的论文，该研究对 8 个国际队列、2,609 人、12,394,834 个白细胞做单细胞 RNA 测序，区分出以颗粒酶 K 或 B 为主的 CD8+ 效应记忆 T 细胞（TemK+ 与 TemB+）。
推荐理由：这篇解读梳理了 8 个队列、260 万白细胞的分析，把免疫衰老的细胞分叉与死亡风险联系起来。