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10月19日周一
  1. 晶泰科技 XtalPi:新闻20

    深圳市委书记靳磊到晶泰科技调研 AI for Science 进展

    10月15日,深圳市委书记靳磊到河套深港科技创新合作区走访晶泰科技,参观其 AI 自主实验平台,并听取联合创始人、首席执行官马健博士汇报公司在 AI for Science 领域的技术布局及人工智能与机器人技术赋能生物医药研发的应用进展。靳磊在听取河套合作区工作汇报后提出,要加强基础研究和应用基础研究,推动科技创新和产业创新深度融合。

  2. 科学网88

    生成式AI系统 RFdiffusion3 可从原子层面设计蛋白质与核酸

    包括戴维·贝克在内的团队开发出生成式AI系统 RFdiffusion3(RFD3),可直接从原子层面设计蛋白质和核酸,生成蛋白质结构的速度约为前代系统 RFdiffusion2 的10倍。在41个已有酶的活性位点计算测试中,RFD3 有37个案例的设计表现优于 RFdiffusion2;实验上设计出可分解对氧磷的酶和可切割特定肽段的蛋白酶,均完成预期化学反应。设计范围还扩展到 RNA 等核酸分子。

    推荐理由:RFD3 把蛋白质设计条件细化到原子位置和氢键,并给出与前代的速度和活性位点对比,可据此判断原子级设计的能力边界。

  3. Bluesky:Ran Blekhman (@blekhman.bsky.social)58

    Ran Blekhman 在 PLOS Biology 谈 AI 生成论文激增与生物学评价

    Ran Blekhman 在 Bluesky 发帖介绍其在 PLOS Biology 发表的文章,讨论 AI 生成论文激增为何构成一类全新问题,以及对生物学领域科学评价方式的影响。文章的核心论点是,在生成式 AI 时代,写出一篇论文不再意味着真的做过科学研究,因此需要重新考虑如何回应 AI 生成论文的涌入。

    推荐理由:文章把 AI 生成论文的激增当作科研评价体系的新问题,讨论生物学研究究竟为了什么。

  4. 公众号:BioArt82

    Nature:Triana Biomedicines 报道可穿越血脑屏障的 ALK 分子胶降解剂 TRI-611

    美国 Triana Biomedicines 公司的 Vito J. Palombella 和 Andrew R. Conery 在 Nature 发表研究,报道了选择性、可穿越血脑屏障的 ALK 分子胶降解剂 TRI-611。

    推荐理由:报道的分子胶降解剂绕开ALK激酶活性位点,在耐药与颅内模型中仍有效,为靶向蛋白降解提供了新降解基序的结构依据。

  5. 公众号:BioArt60

    张帅等团队开发维C化生物正交探针,绘制候选靶标图谱并鉴定GSTP1调控作用

    华中农业大学张帅、浙江大学朱成梁和上海交通大学医学院附属瑞金医院何吓俤等团队在Angew发表论文,开发维生素C生物正交探针平台研究赖氨酸维C化修饰。团队合成炔丙基报告探针VC-1及O-乙酰化前体探针VC-2,用VC-2开展活细胞定量化学蛋白质组学,获得1615个竞争敏感的维C化候选靶标,并在FTO、ALDH1B1、GSTO1、IMPDH1等蛋白上鉴定到探针来源的赖氨酸加合物。

  6. 公众号:返朴40

    停用 SSRI 比戒海洛因还难?争议背后是抗抑郁药安全停药的临床盲区

    返朴梳理了美国卫生与公众服务部部长小罗伯特·肯尼迪关于停用 SSRI 比戒海洛因还难的言论及其学界反驳,指出抗抑郁药停药问题长期缺乏研究。

    推荐理由:文章梳理了 SSRI 停药反应的发生率争议与双曲线减量法,为理解抗抑郁药安全停药这一临床盲区提供了机制与证据层面的背景。

  7. Cell75

    微生物组-胆汁酸轴介导女性对慢性肝病的保护作用

    Cell 在线优先发表研究,提出一条微生物组-胆汁酸轴介导女性对慢性肝病的保护。由雌激素促进的肠道细菌联合体产生的女性富集胆汁酸 isoUDCA,通过 SREBP2-STARD4-CYP7B1 信号促进肝脏胆固醇处理和胆汁酸代谢,从而减轻慢性肝损伤。

    推荐理由:研究把女性慢性肝病保护与肠道菌群来源的胆汁酸 isoUDCA 联系起来,并给出 SREBP2-STARD4-CYP7B1 信号通路这一机制线索。

  8. Nature Genetics75

    研究揭示人早期胚胎中 Polycomb 抑制格局的建立过程

    研究对人类配子、二细胞胚胎、八细胞胚胎、囊胚和胚胎干细胞中的 H2AK119ub(H2Aub)进行图谱分析,发现 H2Aub 最早在二细胞阶段于 GC 富集区域出现,随后逐步累积,并在后期集中于 PcG 靶基因。

    推荐理由:该研究追踪人胚胎从配子到囊胚的 H2Aub 动态,说明 H2Aub 如何引导 H3K27me3 重建 Polycomb 抑制格局。

  9. 公众号:动脉网30

    海博特完成7006万元B+轮融资,加码CRO数智化能力建设

    广州海博特医药科技有限公司完成7006万元B+轮融资,由远翼投资领投,广州健康产投、万联广生、荔湾广药基金、鲸犀投资共同参与。资金将用于迭代AI辅助方案设计与入组可行性评估工具,完善实时数据质控与全过程追溯能力。海博特成立于2009年,累计承接完成1250余项临床研究项目,2026年新推出MedioSeek与MedioCompose两款产品。

  10. Nature Communications58

    DNA-SaM 编解码系统提升 DNA 数据存储可扩展性

    研究提出 DNA-SaM 系统,整合高效编码、严格的生化约束检查和两级索引的存储单元分布架构,用于可扩展的 DNA 数据存储。计算分析显示其编码时间复杂度为线性,编码时间较代表性方法明显缩短,并主动排除同聚物重复、串联重复和潜在启动子基序等可能干扰下游生化过程的序列。该系统在体外和体内实际存储中均取得 100% 成功率,按其编码方案与序列设计空间理论上可存储超过 2^70 PB 数据。

  11. Cell58

    pyrin 炎症小体经 OCTN2 感知肌肉损伤或摄入来源的胞外 ʟ-carnitine

    研究发现,pyrin 炎症小体通过高亲和力肉碱转运体 OCTN2(SLC22A5)感知胞外 ʟ-carnitine,并由此引发 IL-1β 介导的炎症。ʟ-carnitine 是一种在肌细胞中高度丰富的非蛋白氨基酸,过量摄入肌细胞与肌细胞坏死均与全身性炎症相关。作者据此提出,OCTN2 可作为减少外源或内源胞外 ʟ-carnitine 所致炎症的潜在靶点。

  12. Patterns30

    循环视觉模型中自上而下反馈与神经变异性实现稳健推断

    Greco 等发现,循环视觉模型中将自上而下反馈与 dropout 引入的神经变异性结合,可提升感知稳健性。神经变异性防止单元级共适应,反馈通路则将群体活动稳定在紧凑的低维表征中。二者相互作用提示生物视觉系统如何在不确定性下实现稳健感知推断,并为可泛化到分布外条件的人工视觉系统提供设计原则。

  13. Nature Communications58

    dITP 通过改变 Kongming 复合物组装平衡激活 NAD⁺ 水解

    研究发现,dITP 并非通过简单的构象变化激活 Kongming(Kom)系统的 KomBC 复合物,而是通过改变其组装平衡来实现。没有 dITP 时,KomBC 在紧密堆积的寡聚体和松散堆积的纤维之间处于平衡,两者均无活性;dITP 结合到 KomB 后,稳定纤维中紧密堆积的 KomC 核心并让催化残基对齐,从而激活 NAD⁺ 水解。

  14. Nature Machine Intelligence42

    可复用性报告:多样本组学网络推断受先验知识与数据可得性制约的稳健性区间

    对多样本约束网络推断框架 CORNETO 的可复用性评估显示,多样本推断总体提升稳健性与可重复性,但预测性能增益取决于生物学背景和先验网络的完整性。研究在动态造血与稳定皮层数据集上系统评估四种网络重建范式,并引入 bootstrap 聚合与选择性再扩展策略以提升共识稳健性。结果揭示由样本量、先验知识和正则化共同界定的不同推断区间。

  15. Nature Methods58

    miOPM 多浸没斜平面显微镜发布,支持油水空气物镜切换的高分辨光片成像

    研究团队发布多浸没斜平面显微镜 miOPM,一种可重构的高分辨光片荧光显微平台,支持油、水、空气物镜无缝互换,并在 1.33 至 1.51 的折射率范围内保持衍射极限性能。该平台兼容标准样品 mounting、现有透明化流程和通量三维成像,作者用它拍摄了从培养细胞到整体生物、透明化组织的多种样本。原文称其目标是降低先进三维成像的使用门槛。

  16. Nature Genetics72

    379 个人脑样本图谱将 mRNA 3′端选择与脑疾病遗传风险联系起来

    一项新工作在 379 个人脑样本中绘制了可变多聚腺苷酸化这一转录后调控层,显示 3′-UTR 选择上的遗传变异与疾病相关位点及下游分子效应相关。可变多聚腺苷酸化通过改变 mRNA 末端影响 mRNA 稳定性、翻译或亚细胞定位,而不一定改变 RNA 丰度。

    推荐理由:在 379 个人脑样本中绘制可变多聚腺苷酸化图谱,把 3′-UTR 选择相关的遗传变异与疾病位点及下游分子效应联系起来。

  17. GEN48

    Diasome 的 HDV-Insulin 获 IIb 期积极数据,正敲定 T1D III 期计划

    Diasome 在 HDV-Insulin 取得积极的 IIb 期数据后,正敲定针对 1 型糖尿病(T1D)的 III 期试验方案、样本量估算与胰岛素选择,并计划近期与 FDA 讨论关键性研究。该制剂基于其肝细胞靶向囊泡(HDV)脂质纳米颗粒平台,每个盘状颗粒可结合多达 100 个蛋白与多肽,将胰岛素定向递送至肝细胞。

10月18日周日
  1. MedCity News36

    抗生素已经存在,但系统无法将其送达患者

    抗菌药物耐药(AMR)的核心困境不只是新药管线不足,更在于已获批的抗生素和噬菌体制剂常因监管路径割裂、缺乏定价先例、采购停滞和紧急进口机制耗时数周而无法跨国送达患者。文章主张将监管依赖与互认、储备抗菌药的预谈判准入与定价框架、响应时间匹配临床现实的常设紧急准入机制,以及把抗菌药物可及性纳入国家基础设施规划作为优先方向。

  2. Fyodor Urnov58

    NEJM 报告基因治疗后 AAV 插入突变致椎旁肿瘤

    NEJM 刊出 Vo 等人的报告,在一名接受基因治疗的患者椎旁肿瘤中检出 AAV 整合,整合序列保留了 CAG 启动子–增强子并激活了一个发育相关转录因子。Fyodor Urnov 指出这是今年第二例 AAV 驱动插入突变的报告,约 3000 名接受 AAV 治疗者中出现 2 例,比例很低但并非为零,他认为关键在于获益与风险的权衡。